Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC38A7Q9NVC3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms