Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms