Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZCCHC3Q9NUD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms