Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPMQ9NSP4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms