Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms