Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF3Q9NR81 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF3Q9NR81 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms