Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF3Q9NR23 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms