Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSS2Q9NR19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS2Q9NR19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms