Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRDM10Q9NQV6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM10Q9NQV6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM10Q9NQV6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms