Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms