Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms