Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAT1LQ9HCJ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1LQ9HCJ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms