Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POPDC2Q9HBU9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POPDC2Q9HBU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POPDC2Q9HBU9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 326.5 ms