Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
WDR41Q9HAD4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR41Q9HAD4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms