Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CATSPERBQ9H7T0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CATSPERBQ9H7T0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CATSPERBQ9H7T0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CATSPERBQ9H7T0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CATSPERBQ9H7T0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CATSPERBQ9H7T0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CATSPERBQ9H7T0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CATSPERBQ9H7T0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CATSPERBQ9H7T0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CATSPERBQ9H7T0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms