Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAS3Q9H6U6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms