Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNMDQ9H2S6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms