Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP2Q9H175 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2Q9H175 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms