Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2OQ9C0C9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2OQ9C0C9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms