Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms