Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEF2Q9C093 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPEF2Q9C093 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms