Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM4Q9C037 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms