Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPEB1Q9BZB8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPEB1Q9BZB8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms