Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC2Q9BYS8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms