Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A8Q9BY19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms