Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSM14BQ9BX40 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms