Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRI1Q9BV20 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRI1Q9BV20 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms