Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT11Q9BT88 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms