Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP2Q9BSJ2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms