Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIOK1Q9BRS2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIOK1Q9BRS2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms