Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms