Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms