Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP2Q9BQI9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP2Q9BQI9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms