Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNS3Q9BQ31 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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KCNS3Q9BQ31 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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