Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPZ2

SPIN2B, Spindlin-2B, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2BQ9BPZ2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN2BQ9BPZ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIN2BQ9BPZ2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms