Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms