Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRCQ99895 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms