Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNKPQ96T60 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNKPQ96T60 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms