Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms