Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CRBNQ96SW2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRBNQ96SW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms