Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCLRE1CQ96SD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCLRE1CQ96SD1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms