Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms