Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms