Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRNT1Q96Q11 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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