Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3Q96PU9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms