Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD11Q96NU1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms