Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC115Q96NT0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms