Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms