Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRELID3AQ96N28 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms