Protein–RNA interactions for Protein: Q96N23

CFAP54, Cilia- and flagella-associated protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 3,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP54Q96N23 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP54Q96N23 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP54Q96N23 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms